含氟核梭杆菌N-乙酰脲酸溶酶（5ZKA）生物活性化合物

来自牙刷树的多种生物活性化合物通过计算评估，展现具有成药潜力的药代动力学特征，有望作为牙周病替代药物。

Nwaokorie, Francisca Obiageri · Abdalla, Mohnad · Edet, Uwem Okon · Abdalla, Ahmed Mohammed Elamin · Ekomobong, Archimedes Okpo · Shami, Ashwag · Bassey, Ini Ubi · Tayeb, Faris J. · Destiny E., Charlie · Bassey Oyom, David · Nisreen Daffa Alla Omer, Hajedri · Charles, Archibong · Akinboboye Bolanle, Oyeyemi · Alaribe, Stephenie C.

Journal of Molecular Structure 2024

参数信息

对接分数（5-羟甲基糠醛）
-5.5 kcal/mol
对接分数（呋喃-2-羧酸-3-甲基-三甲基硅酯）
-5.9 kcal/mol
对接分数（d-Erythro-Pentofuranose, 2-deoxy-1,3,5-tris-O-(trimethylsilyl)）
-5.2 kcal/mol
RMSD值
1.8 Å
RMSF值
2.0 Å

技术优势

对接分数超过对照药

呋喃-2-羧酸-3-甲基-三甲基硅酯的对接分数为-5.9，优于标准药物甲硝唑的-5.6，表明其与靶蛋白的结合亲和力更强。

分子模拟显示稳定结合

5-羟甲基糠醛和呋喃-2-羧酸-3-甲基-三甲基硅酯的RMSD值低于1.8 Å，RMSF值普遍低于2.0 Å，表明复合物在模拟中保持稳定。

药代动力学优于标准药

ADMET预测显示测试配体的药代动力学性质优于甲硝唑，但呋喃-2-羧酸和d-Erythro-Pentofuranose显示出肝毒性。

应用场景