唐古特大黄基因组

蒽醌合成候选基因

该基因组装配为蒽醌生物合成的遗传基础提供了深入见解，并揭示了关键候选基因，可指导大黄的育种改良。

李瀛 · Wang, Zhenyue · Zhu, Mingjia · Niu, Zhimin · 李敏洁 · Zheng, Zeyu · Hu, Hongyin · Lu, Zhiqiang · 张锦 · 万东石 · Qiao, Chen · 杨勇志

Communications Biology 2023

参数信息

基因组大小

2.76 Gb

染色体数目

11

全基因组复制事件

2

技术优势

染色体水平组装

2.76 Gb基因组被挂载到11条染色体，为基因定位和比较基因组学提供了连续、高质量的参考。

锁定候选基因

通过共表达网络鉴定出与蒽醌生物合成高度相关的模块，包含CHS、CYP450和BGL等关键酶基因。

多组学定位合成部位

代谢分析表明主要蒽醌在根中合成，转录组显示相关基因在根中显著上调，为组织特异性调控提供线索。

应用场景

• 药用植物育种：利用基因组信息开发分子标记，加速高蒽醌含量大黄品种的选育。
• 蒽醌代谢工程：借助候选基因在微生物或植物中重建蒽醌合成途径，实现异源生产。
• 植物天然产物：解析大黄蒽醌类天然产物的遗传基础，推动活性成分的生物制造。
• 中药材基因组学：为大黄等中药材提供高质量参考基因组，支撑功能基因挖掘和品质研究。