IRF5替代启动子

全基因组信号

在自身免疫风险等位基因上，结构性调控因子ZBTB3介导染色质环，促进IRF5长转录本表达，导致IRF5过度活化和M1巨噬细胞极化。

Wang, Zhao · Liang, Qian · Qian, Xinyi · Bolang, Hu · Zheng, Zhanye · Jianhua, Wang · Yuelin, Hu · Zhengkai, Bao · Zhao, Ke · Zhou, Yao · Feng, Xiangling · Xianfu, Yi · Jin, Li · 石建党 · Zhe, Liu · Jihui, Hao · Kexin, Chen · Yu, Ying · Pak Chung, Sham · Wange, Lu · 王晓艳 · Song, Weihong · Li, Mulin Jun

Nature Communications 2023

技术优势

锁定因果变异

通过系统筛选自身免疫病多效性位点，结合表观基因组和eQTL证据，将rs4728142鉴定为排名最高的因果变异，而非仅关联信号。

阐明调控机制

发现rs4728142区域以等位基因特异性方式与IRF5替代启动子相互作用，并通过染色质环调控启动子选择。

鉴定关键中介因子

结构调控因子ZBTB3介导等位基因特异性环，促进风险等位基因上IRF5短转录本表达，为干预提供靶点。

连接表型后果

风险等位基因导致IRF5过度活化并促进M1巨噬细胞极化，与自身免疫病理直接相关。

应用场景