山羊肠道微生物目录

覆盖山羊早期发育全过程的高质量肠道微生物参考基因组集合，包含大量新发现的微生物种类。

Jiao, Jinzhen · 武剑 · Zhou, Chuanshe · 贺志雄 · 谭支良 · 王明

ISME Journal 2024

参数信息

高质量宏基因组组装基因组（MAG）数量

1002

新基因组数量

618

非冗余蛋白质编码基因数量

2.3 million

技术优势

解锁新物种

618个新基因组扩展了山羊羔肠道微生物生命之树，为后续功能研究提供新对象。

功能全景

目录编码超230万个非冗余蛋白质，涵盖多种碳水化合物降解酶和代谢基因簇，揭示纤维分解等关键功能。

发育动态清楚

揭示胃肠道微生物在出生后快速组装，碳水化合物代谢适应分三个阶段进行，为早期干预提供时间窗口。

应用场景

• 反刍动物微生物组：可直接比对宏基因组数据，识别山羊羔胃肠道微生物组成与功能。
• 动物肠道健康：提供早期肠道微生物发育基线，评估健康与疾病状态下的菌群偏移。
• 益生菌开发：筛选与乳酸生成相关的Sharpea和Olsenella等候选菌株，开发益生菌。
• 饲料添加剂：发现调节碳水化合物代谢的微生物靶点，指导植物源添加剂研发。