平鳍鳅染色体水平基因组

首个高质量染色体基因组

首个针对蝴蝶坡流贝类的染色体水平基因组组装，为这种适应湍急山溪的底栖鱼类的遗传与进化研究提供了新的参考。

Zhang, Xinhui · 唐琼英 · Sheng, Qiang · 易少奎

Scientific data 2024

参数信息

基因组大小
459.8 Mb
Contig N50
5.35 Mb
染色体数目
25
BUSCO 完整性
97.0 %
重复序列含量
111.47 Mb
重复序列比例
24.25 %
蛋白质编码基因数
22906

技术优势

基因组连续性高

contig N50 达 5.35 Mb，为后续基因结构和功能研究提供了高质量的序列基础。

染色体水平组装

利用 Hi-C 技术将 contigs 锚定到 25 条染色体，为研究染色体进化和比较基因组学提供资源。

基因组完整度高

BUSCO 分析显示 97.0% 的基因覆盖率，表明基因组组装涵盖了绝大多数保守单拷贝基因。

首个该物种基因组

这是该物种首次基因组测序，填补了蝴蝶坡流贝类基因组资源的空白。

应用场景