西番莲染色体级基因组

揭示基因组与花性状

组装了西番莲染色体级基因组,明确LTR-RTs是影响基因组大小和花性状差异的关键因素。

Yi, Zou · Wang, Jie · Dan, Peng · Zhang, Xiaoni · Tembrock, Luke R. · Yang, Jinliang · 赵建立 · Lian, Hong · Wú, Zhiqiang

Molecular Horticulture 2023

参数信息

基因组大小
424.16 Mb

技术优势

找到差异主因

LTR反转录转座子拷贝数差异是西番莲属基因组大小变异的主要贡献因素,为解析基因组进化提供明确方向。

多组学整合

整合33个样本的转录组、系统发育和代谢组数据,系统分析花器官发育和次生代谢途径。

锁定关键基因

鉴定出花颜色和气味的关键生物合成基因,可直接用于分子育种和遗传改良。

应用场景