太湖新银鱼基因组

无间隙染色体级

提供一个无间隙、染色体水平的太湖新银鱼参考基因组,为研究其进化和生态适应性提供关键资源。

Yanfeng, Zhou · Zhang, Xizhao · Jian, Jianbo · Chenhe, Wang · Fang, Dian · 蒋书伦 · Long, Ren · You, Ge · Wang, Hongqi · 尤洋 · Chen, Chunhai

Scientific data 2023

参数信息

基因组大小
397.29 Mb
Contig N50
15.61 Mb
染色体数目
28
蛋白编码基因数
20024
基因注释比例
98.16 %

技术优势

无间隙组装

结合多种测序技术实现无间隙的染色体水平组装,避免了间隙区域的信息缺失。

高连续性

contig N50达到15.61 Mb,表明组装连续性极高,有利于基因结构和调控元件的完整解析。

全面注释

预测并注释了20,024个蛋白编码基因,其中98.16%在公共数据库中获得功能注释。

应用场景