梅花T2T单倍型基因组

解析花色苷缺失机制

为梅花花色苷缺失表型提供了完整的端粒到端粒无缺口基因组参考,可用于基因挖掘和基因组进化研究。

Zhou, Pengyu · 黄小 · Tan, Wei · 高峰 · Bai, Yang · Ma, Chengdong · Yufan, Ma · Ni, Zhaojun · 侍婷 · Shao, Jing · 高志红

Molecular Horticulture 2026

参数信息

基因组大小(LE_hap1)
229.29 Mb
基因组大小(LE_hap2)
228.36 Mb
Contig N50
27.65–27.79 Mb
蛋白质编码基因数(LE_hap1)
24318
蛋白质编码基因数(LE_hap2)
24316

技术优势

无缺口

基因组实现了端粒到端粒的无缺口组装,消除了此前版本中的未锚定区域和间隙。

找到关键基因

PmGSTF2 基因的提前终止密码子被证实是花色苷积累减少的关键原因。

双倍型完整

提供了两个单倍型基因组(LE_hap1 和 LE_hap2),分别长约 229 Mb 和 228 Mb。

基因注释全

每个单倍型注释到约 2.4 万个蛋白质编码基因,为功能研究提供了完整基因集。

应用场景