水稻泛基因组

74个高质量基因组整合

整合74个长读长测序基因组,覆盖亚洲栽培稻和野生稻所有生态型与分类群,解析水稻驯化与去驯化的基因组基础。

吴东亚 · Sun, Yanting · Lai, Jia · 丁超峰 · 沈恩惠 · Ye, Yi · Qian, Jiasheng · 樊龙江

Genome Biology 2023

参数信息

整合基因组数
74
着丝粒渗入区块长度
4.5 Mbp

技术优势

覆盖最全

整合74个高精度基因组,涵盖亚洲栽培稻和普通野生稻的所有生态型与分类群,避免了此前研究中因群体代表性不足导致的偏差。

解析驯化起源

鉴定出从古代粳稻向古代籼稻或其野生祖先渗入的基因组区域,包括几乎所有已知驯化基因和一个4.5-Mbp的着丝粒跨越区块,支持主要水稻亚种的一次驯化事件。

揭示去驯化机制

通过比较杂草稻与栽培稻的基因组,凸显野生渗入对杂草稻去驯化综合征形成的贡献,为杂草稻防控提供了基因组线索。

应用场景