入侵性梧桐花边虫基因组

揭示入侵适应机制

高质量的染色体级别基因组,结合全球重测序分析,揭示了氧化应激和耐热性提升的适应性进化特征。

Du, Zhenyong · Wang, Xuan · Yuange, Duan · 刘山林 · 李田 · 宋凡 · 彩万志 · 李虎

Genomics, Proteomics and Bioinformatics 2024

参数信息

蛋白编码基因数
15,278
SNP数量
2.74 million
入侵路径数
2

技术优势

基因组完整

利用PacBio、Illumina和Hi-C技术组装出染色体级别的基因组,为后续比较基因组学研究提供可靠参考。

样本覆盖广

对来自三大洲9个入侵国家和原产地的402个样本进行重测序,捕获全球范围的遗传变异。

解析入侵路径

鉴定出两条主要入侵路线,并在东亚形成接触区,为追溯传播历史提供依据。

找到适应基因

与入侵相关的选择信号与扩张基因重叠,指向氧化应激和耐热性提高,为理解快速适应提供候选基因。

应用场景