蔬菜斑潜蝇染色体级基因组
五条染色体锚定
首个蔬菜斑潜蝇染色体水平参考基因组，为解析其入侵机制和适应性进化提供关键基础。
蔡小东 · Fan, Zheng · 陈卓 · 杨定
Scientific data 2025
参数信息
- 组装大小
- 110.98 Mb
- 锚定到染色体的比例
- 92.08 %
- Contig N50
- 1.16 Mb
- BUSCO完整度
- 94.9 %
- 重复序列含量
- 30.39 Mb
- 重复序列占比
- 27.38 %
- 预测蛋白编码基因数
- 10,312
- 功能注释比例
- 96.76 %
技术优势
可做全基因组比较
染色体级组装和完整注释使跨物种比较成为可能，有助于研究入侵相关基因的进化。
基因注释完整
96.76%的预测基因得到功能注释，为基因功能研究提供可靠资源。
应用场景
- 农业害虫基因组学：用于比较基因组分析，揭示害虫适应性进化机制。
- 入侵物种管理：提供入侵机制研究的基础，支持开发针对性防控策略。
- 蔬菜作物保护：助力发现防治靶点，减少蔬菜作物损失。