深度密集检索模型

同源蛋白检出更快更全

基于蛋白质语言模型与双编码器架构，无需序列比对即可捕获远程同源关系，为蛋白质进化与功能研究提供新的视角。

Hong, Liang · Zhihang, Hu · Siqi, Sun · Zheng, Liangzhen · Wang, Sheng · 许胜 · King, Irwin · Gerstein, Mark B. · 李煜

Nature Biotechnology 2024

参数信息

速度提升倍数（PSI-BLAST/DIAMOND）

22 x

速度提升倍数（HMMER）

28,700 x

技术优势

揭示未知蛋白关联

DHR 独家发现的远程同源蛋白有助于连接已充分研究的蛋白质，增进对蛋白质进化、结构和功能的理解。

应用场景

• 蛋白质功能预测：用 DHR 找同源蛋白来推测未知蛋白的功能，无需序列比对，快速且全面。
• 酶挖掘：在大型数据库中快速检索远程同源蛋白，发现新型酶或已知酶的远源变体。
• 药物靶点发现：揭示药物靶点蛋白的远程同源关系，帮助拓展可成药靶点。
• 合成生物学元件设计：从海量序列中挖掘同源元件，为设计合成生物学模块提供候选序列。
• 蛋白质工程：通过远程同源分析定位结构功能关联，指导蛋白质理性改造。