糖肽鉴定更灵敏
DeepGP结合图神经网络与Transformer，能准确预测糖肽的串联质谱和保留时间，从而提升糖肽鉴定的灵敏度。
Zong, Yu · Wang, Yuxin · 邱锡鹏 · 黄萱菁 · 乔亮
Nature Machine Intelligence 2024
在多个生物数据集上，DeepGP 预测的串联质谱和保留时间与实验结果高度吻合，可以直接用于辅助鉴定。
在合成和生物数据集上的系统评测表明，DeepGP 能够有效区分结构相近的糖链，减少错误鉴定。
与数据库搜索联用，在多种诱饵方法评估下，DeepGP 能提高糖肽的检出数量。