DdCBE线粒体碱基编辑器

可预测精准编辑

通过揭示编辑窗口和序列偏好规则,使线粒体DNA碱基编辑的结果可提前预测,无需繁琐筛选即可实现高效无旁观者效应的精确编辑。

Qiu, Jiaxin · Wu, Haibo · Xie, Qin · Gao, Yining · Suo, Lun · 匡延平

Frontiers in Bioengineering and Biotechnology 2024

参数信息

aC靶点编辑窗口起始位点
8
aC靶点编辑窗口结束位点
11
aC靶点编辑窗口起始位点
10
aC靶点编辑窗口结束位点
13
tC靶点编辑窗口起始位点
4
tC靶点编辑窗口结束位点
13
tC靶点编辑窗口起始位点
5
tC靶点编辑窗口结束位点
14

技术优势

编辑窗口可预测

明确了aC靶点编辑窗口集中在5'C8-11(G1333)和5'C10-13(G1397),tC靶点窗口为5'C4-13(G1333)和5'C5-14(G1397),从而无需预先筛选即可选择最佳靶点。

无旁观者效应

借助编辑规则构建的携带致病mtDNA突变的细胞模型,实现了高效率且无旁观者效应,保证了编辑的特异性。

免于优化筛选

通过理解编辑规律,研究者可以设计最优策略,避免耗时耗力的优化筛选工作,从而加速研究进程。

应用场景