重建三维空间分布
通过保持细胞关联网络的介观组织,免标志物从头重建单细胞三维空间结构。
Zhao, Yuxuan · Zhang, Shiqiang · 徐健 · 余佯洋 · 彭广敦 · Cannistraci, Carlo Vittorio · Han, Jing Dong Jackie
Advanced Science 2023
无需预定义标志基因或空间坐标,直接从细胞间转录组关联网络出发重建空间分布。
算法设计同时支持寡细胞和单细胞转录组数据,扩展了空间重建的适用范围。
在 14 个数据集、497 次重建的全面对比中,显著优于现有仅有的两种从头重建方法。