scDECL 单细胞聚类算法

先验约束提升聚类

针对高噪声、高维度、稀疏的scRNA-seq数据,引入对比学习与成对约束,使聚类结果更符合真实细胞类型。

甘杨兰 · Yuhan, Chen · 徐光伟 · Guo, Wenjing · 邹国兵

Briefings in Bioinformatics 2023

技术优势

聚类更准

在六个真实数据集上全面超越六种最先进算法,更好地识别细胞类型和状态。

先验知识用得上

将先验信息转化为增强成对约束来引导聚类,突破传统方法对先验知识利用不足的限制。

抗噪更稳健

采用 mixup 数据增强和插值损失,提升模型对噪声和稀疏性的鲁棒性。

应用场景