空间共表达配体-受体数据库

提供单点分辨率下的配体-受体工作点空间分布与高置信度的细胞通讯模式,可用于在复杂微环境中系统定位差异化的细胞合作与信号事件。

Zhuoxuan, Li · Liu, Pengtao · 黃淵華

Nature Communications 2023

技术优势

点级分辨率定位互作

能识别配体-受体共表达的局部区域,而不只是给出细胞类型对,可直接定位互作发生的空间热点。

可扩展至数百万点

通过推导解析零分布避免置换检验的计算瓶颈,使方法能够处理大规模空间转录组数据。

条件间差异互作识别

在多种数据集中识别条件之间的差异化相互作用,支持发现环境特异的细胞合作与信号事件。

应用场景