空间XCR测序方法

实现亚细胞分辨率下原位同时获取T/B细胞受体序列与空间转录组信息。

张阳 · 刘成武 · Liu, Yi · Zhou, Wenwen · Zeng, Hui · Dong, Xuan · Zhu, Fan · Hou, Sen · 高志冬 · Chan, Francis Ka Ming · Yao, Yin · Liu, Chuanyu · 刘龙奇 · 徐讯 · Hou, Yong · 孙汉勇 · Zuo, Li · 王华 · 刘心 · 武志芳 · 周京颖 · Zexian, Zeng · Feng, Yu

Nature Communications 2026

参数信息

肺腺癌样本数

11

技术优势

高保真捕获

直接从空间转录组cDNA文库中回收TCR和BCR序列，避免了额外建库带来的偏倚，确保克隆型信息与空间位置精确对应。

亚细胞分辨率

方法在亚细胞分辨率下原位获取受体序列和转录组，能够分辨同一细胞内的RNA分布，从而更精细地定位克隆活动。

鉴定新结构

在11例肺腺癌中发现IgG+浆细胞聚集体具有异位生发中心样特征，能够筛选来自远端未成熟三级淋巴结构的肿瘤反应性克隆，揭示肿瘤内免疫哨所。

关联治疗响应

这些IgG+浆细胞聚集体的存在指示更强的抗肿瘤免疫监视和对免疫检查点阻断治疗更高的敏感性，为临床分层提供标志物。

应用场景

• 肿瘤免疫微环境分析：原位锁定肿瘤内淋巴细胞克隆及其周围微环境，揭示免疫监视的空间组织。
• 免疫组库测序：无需分离细胞即可从空间转录组数据中获取T/B细胞受体序列，保留空间坐标。
• 空间组学数据分析：整合受体序列与基因表达的空间分布，分析克隆扩增与微环境特征的共定位。
• 单细胞多组学：在同一细胞水平同时获得转录组和免疫组库信息，无需额外单细胞分离。