知识引导嵌入主题模型

单细胞聚类更准

通过外部知识引导与嵌入聚类正则化，该模型学习到更具多样性且与生物学通路更一致的细胞主题，克服了现有嵌入主题模型主题冗余、生物信息覆盖不全的局限。

Hegang, Chen · Lu, Yuyin · Zhao, Yifan · 戴智明 · Wang, Fu Lee · 李青 · 饶洋辉 · Li, Yue

Nature Communications 2026

技术优势

在20个数据集上聚类性能超过7种最先进方法

主题多样性更高，与生物学通路一致性更强

在黑色素瘤数据上识别恶性特异性主题

在干扰素刺激的PBMC数据上模拟主题扰动，将对照细胞转向刺激状态