番茄基因组多靶点CRISPR文库

攻克基因冗余

针对番茄全基因组基因家族设计多靶点sgRNA，一次编辑克服功能冗余，可规模化用于作物性状筛选与育种。

Su, Ning · Chakraborty, Joydeep · Liu, Jia Jia · 魏伟 · Mayrose, Itay · 张雨青 · Shani, Eilon

Nature Communications 2025

参数信息

独特sgRNA数量

15804

独立CRISPR株系

1300

子文库数量

10

技术优势

一次编辑多个基因

每条sgRNA靶向同一基因家族内多个基因，单次转化就能克服功能冗余，无需逐个敲除。

规模可扩展

设计了15,804条独特sgRNA并生成约1300个独立株系，证明文库适用于大规模基因编辑。

可追踪sgRNA

CRISPR-GuideMap双条形码系统可大规模追踪植物中的sgRNA，便于筛选和验证。

应用场景

• 作物基因编辑：替代逐个基因敲除，一次转化即实现多基因编辑。
• 番茄育种：用于番茄重要农艺性状相关基因家族的功能筛选与聚合。
• 植物功能基因组学：在大规模水平上揭示基因家族成员的冗余与分工。
• 果实品质改良：快速鉴定控制果实发育、风味和养分吸收的基因，加速品质改良。