单细胞因果网络推断

并行蜂群寻优

一种基于并行离散人工蜂群算法的贝叶斯网络方法,用于从单细胞数据中高效推断因果蛋白信号网络,在模拟和真实数据集上优于现有方法。

刘金铎 · Jihao, Zhai · 冀俊忠

CAAI Transactions on Intelligence Technology 2024

技术优势

全局最优解

并行人工蜂群算法能够搜索具有最高离散K2度量的全局最优因果网络结构,而非局部最优。

算得更快

并行搜索机制降低计算时间,在性能相当或更好的同时提高计算效率。

细胞间不用独立

避免了忽视不同单细胞间蛋白信号分子相互作用的局限性,使推断的网络更接近真实生物机制。

应用场景