蛋白质特异零样本预测器

新靶点无需重训

通过子图匹配定位结合口袋,该模型对未见蛋白质与药物展现出优于现有方法的预测能力。

Wang, Yuxuan · Xia, Ying · 严骏驰 · Yuan, Ye · 沈红斌 · 潘小勇

Nature Communications 2023

技术优势

新靶点也能预测

采用蛋白质特异元学习,每个蛋白质单独建模,因此对未见蛋白质也能给出预测。

定位结合口袋

引入弱监督子图信息瓶颈模块,从蛋白质图中找出与药物结合最相关的子图,提高可解释性。

少量数据微调

对于只有少量已知结合伙伴的蛋白质或药物,微调后仍能取得良好表现。

应用场景