5fC单碱基测序法

免亚硫酸氢盐

通过化学标记与脱氨测序，精准区分5fC与其他胞嘧啶修饰，无需亚硫酸氢盐处理，适用于全基因组单碱基分辨率图谱构建。

Gaojie, Li · 雄军 · 刘飞 · Ji, Tong Tong · 王敏 · Guo, Xia · 冯钰锜 · 慈维敏 · 袁必锋

Analytical Chemistry 2024

技术优势

单碱基分辨

通过化学标记富集与A3A脱氨测序，5fC被特异读出，而其他胞嘧啶形式均被读为T，实现精确识别。

免亚硫酸氢盐

避免了亚硫酸氢盐处理导致的DNA降解和序列偏好，保留更多有效信息。

应用场景

• 表观遗传学分析：用于绘制5fC全基因组图谱，解析其与组蛋白修饰及基因表达的关系。
• DNA修饰检测：直接检测DNA中的5fC修饰，无需亚硫酸氢盐转化。
• 基因组测序：为基因组测序提供单碱基分辨率的5fC位置信息。