40K SNP芯片

基于GBTS技术专为拟穴青蟹开发的高多态性基因分型芯片,可高效支撑基因组选择与全基因组关联分析。

叶绍潘 · Xiyi, Zhou · Min, Ouyang · Cui, Wenxiao · Zifei, Xiang · 张银 · 袁野 · Mhd, Ikhwanuddin · Li, Shengkang · Zheng, Huaiping · 章跃陵 · Ma, Hongyu

Aquaculture 2025

参数信息

位点多态性
92.70 %
个体检出率
97.02 %
SNP一致性
0.986
基因型一致性
0.954
体重遗传力
0.887
体重预测准确度
0.535

技术优势

位点多态性高

该芯片位点多态性超过92.70%,确保在青蟹群体中获得丰富的遗传变异信息,提高遗传分析的准确性。

基因分型一致性好

与重测序数据相比,芯片的平均SNP一致性为0.986,基因型一致性为0.954,验证了芯片分型的准确性。

支撑基因组选择

利用该芯片数据进行GBLUP预测,体重、体高、体长、体宽的预测准确度分别达到0.535、0.544、0.574、0.585,表明芯片适用于青蟹基因组选择。

应用场景