SARS-CoV-2刺突蛋白FCS环

广谱蛋白酶对接位点

14个氨基酸残基在S1/S2连接处形成反平行β-折叠并折叠出短环,环内含PRRAR序列,可作为TMPRSS2和α1AT等蛋白酶的对接位点,为抗病毒药物筛选提供靶点。

Li, Shun · 叶昱 · Fahim, Bashir · Shah, Naveed Nazir · 薛孟周 · Wang, Huiqing · Zheng, Chunfu

International Journal of Biological Macromolecules 2024

参数信息

FCS区域残基数
14
分子动力学模拟时长
300 ns

技术优势

找到天然对接位点

短环内的PRRAR序列可被TMPRSS2和α1AT等蛋白酶识别,为药物设计提供明确靶点。

揭示变异影响

B.1.1.7变异株(HRRAR)中反平行β-折叠含量降低、环含量增加,可能改变蛋白酶结合。

多配体结合能力

RBD的β6和大部分环参与配体结合,可用于治疗SARS-CoV-2感染。

应用场景