白魔芋基因组
高质量染色体级
提供白魔芋完整基因组序列和注释,为魔芋抗病机制研究和遗传改良奠定基础。
Shen, Chuan · 秦宝福
Frontiers in Plant Science 2024
参数信息
- 基因组总大小
- 5.94 Gb
- Contig N50
- 5.61 Mb
- 基因家族数
- 19,908
- 特有基因家族数
- 467
技术优势
解析抗病通路
转录组与代谢组整合分析显示,差异表达基因和差异代谢物显著富集于苯丙烷生物合成、植物激素信号转导等通路,为抗白绢病机制提供候选靶点。
应用场景
- 魔芋抗病育种:利用基因组和抗病通路信息挖掘抗白绢病基因,辅助分子标记选育。
- 魔芋加工:通过基因组解析魔芋葡甘聚糖合成相关基因,为高产量加工原料改良提供靶点。
- 作物基因组学:提供染色体级参考基因组和进化分析,丰富天南星科作物比较基因组资源。