比肩对接模型
用特征融合与知识蒸馏,在无对接结构下实现可与基于对接模型相比的预测精度,并提供可解释的相互作用分析。
Lu, Ruiqiang · 王峻 · 李朋勇 · Li, Yuquan · Tan, Shuoyan · Pan, Yiting · Liu, Huanxiang · Gao, Peng · Xie, Guotong · Yao, Xiaojun
Briefings in Bioinformatics 2023
采用知识蒸馏将基于复合物模型的知识迁移到无复合物模型,避免耗时的分子对接过程即可快速预测亲和力。
通过可视化研究发现模型能够为成对相互作用提供有意义的解释,增强了对预测结果的理解和信任。
在公共亲和力预测和虚拟筛选数据集上,模型性能超越此前最优模型,并达到与基于复合物模型相当的水平。