知识增强图对比编码器

药物分子性质识别更准

用元素知识与药物相似度引导对比学习，得到更可靠的分子表征编码器。

Dong, Kunjie · Zhang, Yanhui · 林晓惠

Expert Systems with Applications 2025

技术优势

增强不改化学结构

采用化学元素领域知识生成两个增强分子图，不改变分子化学结构，从而保留分子语义与结构。

对比目标含先验知识

利用药物相似度的定量估计作为指导，对不同分子组成的样本对进行区分性推远，从而捕获精确的先验知识。

多个编码器联合决策

利用在特征分子图和两个元素知识增强分子图上训练好的编码器共同决定最终预测。

应用场景

• AI辅助药物发现：为药物发现流程提供预训练编码器，提升性质预测准确性。
• 分子性质预测：直接用于分子性质预测任务，在多个基准数据集上取得优越性能。
• 图神经网络应用：展示了面向分子图的图对比学习新方式，可迁移至其他图神经网络任务。