海底曲霉基因组资源

一株来自海底2.4公里、2000万年前含煤沉积物中的Aspergillus sydowii菌株,其基因组测序与组装完成,为研究极端环境微生物适应机制和挖掘新型酶资源提供基础。

姜鹏 · 刘璇 · 廖奕 · 单军 · Zhu, Ping · Chang-Hong, Liu

Frontiers in Microbiology 2023

具体参数

基因组大小
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contigs N
{'zh': '4.6', 'en': ''} Mb

技术优势

编码12,488个假定基因

与陆生菌株CBS593.65相比,海底菌株含更多碳水化合物活性酶(CAZymes)及独特的囊泡融合与自噬相关基因