牛2/28罗伯逊易位基因组

高原适应新线索

从大染色体到肌肉重塑，为高原适应提供分子蓝图

Li, Yan · Wang, Sheng · Zhang, Zhe · Jing, Luo · 林国亮 · 邓卫东 · Zhifan, Guo · Feng Ming, Han · Li-Li, Wang · Jie, Li · Shi-Fang, Wu · 刘鹤群 · Sheng, He · Murphy, Robert W. · Zi-Jie, Zhang · David N., Cooper · Dongdong, Wu · Ya-Ping, Zhang

Molecular Biology and Evolution 2023

参数信息

重组率变化

0

基因渐渗变化

0

技术优势

解析到碱基对

提供染色体级参考基因组，在碱基对水平揭示易位断点结构，为研究融合机制提供精确序列基础。

挑战经典假说

发现融合区域重组率和基因渐渗并未减少，不支持融合引起减数分裂功能障碍导致物种形成的传统观点。

找到肌肉适应线索

许多位于融合染色体上的肌肉相关基因表达显著变化，结合肌原纤维组成基因的结构变异，可能驱动了牛对山地环境的肌节快速适应。

应用场景

• 高原动物基因组：为高原动物比较基因组学提供染色体级参考和易位断点，用于分析适应性演化。
• 家畜遗传改良：鉴定与肌肉发育相关的基因组变异和表达变化，可作为家畜肉质和适应性改良的分子靶标。
• 肌纤维发育：揭示易位引起的肌肉相关基因表达改变和肌原纤维结构变异，为肌肉发育调控提供候选基因。