黄盖鲽皮肤抗菌肽

抗病原体诱导表达

首次从黄盖鲽皮肤转录组中鉴定出7种新型抗菌肽,在病原体刺激下特异性高表达,有望用于鱼类病害防治。

Hui, Liu · Shuai, Wang · Zheng, Zhang · Huixiang, Yan · Tingting, He · Xiaoyan, Wei · Yanyan, Shi · Yan, Chen · 王魏 · 李雪洁

Fish and Shellfish Immunology 2024

参数信息

新型抗菌肽数量
7
功能注释转录本数量
30498
完整 ORF 比例
58.83 %
SSR 数量
10195

技术优势

抗菌肽数量明确

首次从黄盖鲽皮肤中系统鉴定出7种抗菌肽,覆盖四个家族,为筛选候选分子提供了明确清单。

皮肤高表达

这些抗菌肽在皮肤中的表达具有组织偏好性,并在病原体刺激下上调,提示其在黏膜免疫中直接发挥作用。

数据量充足

Nanopore 测序获得 7.72 GB 清洁数据,注释了 30,498 条转录本,为后续研究提供了丰富的序列资源。

应用场景