蛋白质反向折叠精炼网络

记忆高效全局关注

一种基于熵的残基选择方法去除噪声,充分利用去噪上下文,在多个序列设计基准上取得最优性能。

Xinyi, Zhou · Chen, Guangyong · Junjie, Ye · Ercheng, Wang · 张军 · Mao, Cong · 郝建业 · 黄行许 · Jin, Tang · Ann Heng, Pheng

Nature Communications 2023

参数信息

转座酶 B 变体数目
20
活性提升变体数
6

技术优势

去噪更干净

基于熵的残基选择直接删除低置信度残基,避免噪声干扰序列生成。

省显存

全局图注意力模型采用内存高效设计,可处理更长蛋白质。

基准第一

在多个序列设计基准上取得最优性能。

基因编辑活性提升

重新设计的转座酶 B 变体中,六种表现出更高的基因编辑活性。

应用场景