域自适应解卷积算法

跨平台精准估算

通过域自适应匹配消除单细胞与整体RNA-seq间的分布差异,无需配对参考即可高精度估算组织细胞构成。

Ju, Fen · Zhao, Chenguang · 鱼亮

Advanced Science 2023

技术优势

无需匹配参考

通过将单细胞和整体 RNA-seq 转换到共享特征空间,消除了对匹配单细胞参考的依赖,避免了因参考不匹配导致的偏差。

细胞类型识别更准

利用生成的细胞类型特异性表达矩阵,在整体组织中精确识别细胞类型,即使相似细胞类型也能有效区分。

经实验验证

在小鼠脊髓组织上进行单细胞和整体 RNA-seq 实验,应用 SCROAM 识别整体组织中的细胞类型,结果证明其有效性。

应用场景