图基础单细胞模型

千万级细胞预训练

通过图预训练整合基因先验知识，为单细胞分析提供可迁移的基础模型。

方辰 · Wentao, Cui · Hu, Zhilong · Liu, Wenhao · Shubai, Chen · Cong-Cong, Li · Liu, Yana · Jiang, Haiping · 汪鹏飞 · Pan, Jia · 胡国平 · Liu, Guole · Meng, Zhen · 周园春 · 陈凌辉 · 冯桂海 · Xin-Xin, Li

National Science Review 2025

参数信息

预训练细胞数
50,000,000
微调任务数
4
基因节点特征类型
3
基因边特征视角数
3

技术优势

先验知识直接进图

基因节点特征和边特征显式编码已知调控信息，而不是只靠序列顺序暗示关系。

一个底座通吃多任务

同一预训练模型只需不同微调即可用于批次整合、细胞注释、扰动和敲除预测，不必每个任务单独建模。

应用场景