单细胞测序图谱

揭示成肌调控

该单细胞转录组与染色质图谱揭示了猪胚胎肌生成中的关键调控因子，为骨骼肌发育和相关疾病研究提供了新资源。

Cai, Shufang · Hu, Bin · 王晓雨 · Tongni, Liu · Zhuhu, Lin · Tong, Xian · Rong, Xu · Meilin, Chen · Duo, Tianqi · 朱其 · Liang, Ziyun · Li, Enru · 陈瑶生 · 李剑豪 · 刘小红 · Mo, Delin

BMC Biology 2023

技术优势

找到关键调控因子

通过整合染色质可及性和基因表达数据并结合体外实验，确定EGR1和RHOB是猪胚胎肌生成的关键调控因子，为功能研究提供明确靶点。

揭示分化轨迹

在单细胞水平构建了猪骨骼肌发育的连续分化轨迹，并展示了基因表达和染色质可及性的动态变化与细胞类型特异性转录因子活性的一致性。

提供跨物种资源

沿分化轨迹上调的新基因在肌营养不良小鼠中表达高于健康小鼠，表明这些基因可能参与肌生成，为人类肌肉疾病研究提供候选基因。

应用场景

• 肌肉发育研究：获取猪胚胎肌生成的单细胞图谱，用于解析肌肉发育的基因调控网络。
• 比较基因组学：将猪的肌生成数据与模式生物比较，寻找跨物种保守的调控机制。
• 肌肉疾病模型：利用在肌营养不良小鼠中高表达的新基因，筛选人类肌肉疾病的候选靶点。
• 农业动物育种：基于关键调控因子如EGR1和RHOB，设计分子标记辅助选择以改良猪的产肉性状。