全基因组规模预测
一个基于深度学习的模型，利用大量表达数据解析基因调控网络，并发现了叶片衰老的新调控因子。
Chaocheng, Guo · Zhuoran, Huang · Chen, Jiahao · Yu, Guolong · 王玉东 · 王旭
Plants 2024
DEGRN 利用 bulk 和单细胞 RNA-Seq 的高维表达数据，无需预先定义候选调控关系即可推断基因互作。
模型预测了超过 300 万条互作，涉及 1,430 个转录因子和 13,739 个非转录因子基因，远超传统方法的覆盖范围。
在叶片衰老过程中鉴定出转录因子 MAF5，其突变体比野生型更早出现叶片衰老，提示其调控作用。