海洋微生物基因组集

发现新型CRISPR-Cas9

从全球海洋宏基因组中恢复43,191个基因组，发现具有生物技术应用潜力的新型酶和抗菌肽。

Chen, Jianwei · Sun, Ying · Liu, Kun · Yang, Tao · 庄昀筠 · 王大志 · Seim, Inge · 江凌 · 王禄山 · Lee, Simon Ming Yuen · 张国强 · Wei, Xiaofeng · Yue, Zhen · Zheng, Shanmin · 王森 · Chen, Jing · Wang, Jun · 贾晓东 · 夏章勇 · 张核 · 刘心 · Wang, Jian · 杨焕明 · Kristiansen, Karsten · 徐讯 · Mock, Thomas · 李盛英 · 章文蔚 · 范广益

Nature 2024

参数信息

恢复基因组数量
43,191
新发现CRISPR-Cas9系统数量
1
抗菌肽数量
10
PET降解酶数量
3
涵盖门类数
138

技术优势

一次拿到海量基因组

涵盖138个门，大大扩展了可挖掘的序列空间，为发现新功能元件提供充足原料。

已发现可用工具

从中发现新型CRISPR-Cas9系统、10种抗菌肽和3种PET降解酶，且经过体外实验证实有效，可直接用于后续开发。

揭示基因互斥规律

发现CRISPR-Cas系统与抗生素抗性基因存在复杂权衡，为基因编辑应用时避开抗性背景提供参考。

应用场景