4'-SCF3尿苷探针

活细胞内RNA二级结构超灵敏

一种修饰尿苷酸，掺入RNA后成为19F NMR探针，能区分单链与双链并用于活细胞内RNA结构研究。

Fan, Chaochao · Trajkovski, Marko · 李强 · Chen, Yating · Cui, Chaoyu · Lu, Kuan · Zhou, Yifei · Wang, Baifan · Su, Xun Cheng · Plavec, Janez · 周传政

Journal of Organic Chemistry 2025

具体参数

修饰后

{'zh': '19', 'en': ''} F

技术优势

超灵敏19F探针

4'-SCF3基团与相邻核糖2'-OH形成强相互作用，导致19F共振显著上移，信号变化明显。

不干扰RNA结构

NMR结构解析表明，4'-SCF3基团很好地容纳在小沟中，未引起显著的结构扭曲。

适用于活细胞

该探针可在活细胞内检测RNA结构，发现rG4在细胞内稳定性低于体外。

应用场景

• RNA结构生物学：用于检测RNA二级结构形成与变化。
• NMR生物化学：作为19F NMR探针，提高检测灵敏度和分辨率。
• RNA药物设计：评估靶向RNA药物的结合和构象影响。
• 活细胞成像：在活细胞内实时监测RNA结构。