LTR逆转座子主导
首个果树中主要依赖转座子而非串联重复构成的着丝粒,为植物着丝粒多样性与进化提供新机制。
王国梁 · Li, Jiao · 刘贵明 · 刘志国 · 刘孟军 · Yang, Meng
Horticulture Research 2025
单倍型解析的T2T基因组结合CENH3 ChIP-seq,无需逐个分析重复序列,直接精确标定所有着丝粒位置。
枣树着丝粒主要由Gypsy型LTR逆转录转座子构成,而非典型串联重复,为鉴定非模式植物着丝粒提供了新思路。
鉴定到枣树特异的着丝粒富集LTR家族CRJ,其在末端LTR区丰度远高于内部转座子区域,可作为着丝粒标记。
CRJ来源LTR片段的早期插入促成了串联重复样结构的形成,为转座元件与着丝粒串联重复进化提供了机制联系。