枣树着丝粒

LTR逆转座子主导

首个果树中主要依赖转座子而非串联重复构成的着丝粒,为植物着丝粒多样性与进化提供新机制。

王国梁 · Li, Jiao · 刘贵明 · 刘志国 · 刘孟军 · Yang, Meng

Horticulture Research 2025

参数信息

着丝粒大小范围
0.75–1.40 Mb

技术优势

一次标定全部着丝粒

单倍型解析的T2T基因组结合CENH3 ChIP-seq,无需逐个分析重复序列,直接精确标定所有着丝粒位置。

无需依赖串联重复

枣树着丝粒主要由Gypsy型LTR逆转录转座子构成,而非典型串联重复,为鉴定非模式植物着丝粒提供了新思路。

发现着丝粒富集家族

鉴定到枣树特异的着丝粒富集LTR家族CRJ,其在末端LTR区丰度远高于内部转座子区域,可作为着丝粒标记。

揭示重复序列起源

CRJ来源LTR片段的早期插入促成了串联重复样结构的形成,为转座元件与着丝粒串联重复进化提供了机制联系。

应用场景