Oct4同源结构域

专一结合甲基化DNA

该结构域能以同源二聚体形式特异性结合甲基化CpG回文序列,而其他POU因子不结合,为调控甲基化DNA区域的基因提供了新靶点。

Tan, Daisylyn Senna · Cheung, Man Lai · Gao, Ya · Shi, Liyang · Wu, Chien-Te · Hutchins, Andrew Paul · Cojocaru, Vlad · Jauch, Ralf

Nucleic Acids Research 2023

技术优势

只靠同源结构域就能结合

二聚体Oct4与CpGpal的结合由POU同源结构域驱动,而POU特异结构域与DNA分离,因此可构建仅含同源结构域的蛋白来识别甲基化DNA。

其他POU因子不抢这个位点

与Oct4不同,Brn2及体细胞中表达的其他POU因子不结合CpGpal元件,因此Oct4同源结构域可在细胞内特异性标记或操控这些位点而无其他家族成员干扰。

重编程中仍能用

在体细胞重编程为iPSC过程中,大多数Oct4结合增强子发生去甲基化,但CpGpal位点常常保留甲基化,而Oct4仍能结合这些位点,因此可在重编程过程中用于靶向仍甲基化的调控区域。

应用场景