野牡丹开花时间相关基因组区域

利用极端混池F2群体鉴定出与开花时间差异相关的染色体7大倒位区域，其中包含多个已知开花基因。

Chen, Jingfang · 中央 · 刘莺 · 周仁超

International Journal of Molecular Sciences 2024

参数信息

开花时间相关基因数

1872

花序花数相关基因数

680

技术优势

定位到关键倒位

在染色体7上发现两物种间的大倒位，与开花时间差异相关，含多个已知开花基因，解释了重组抑制。

提供大量候选基因

鉴定出1872个开花时间相关候选基因和680个花序花数相关候选基因，包括已知功能基因如CSTF77、FY、PNF等，可直接用于后续功能验证。

揭示多基因控制

花序花数在野牡丹中受多基因控制，没有主效基因，为复杂性状改良提供新认识。

应用场景

• 观赏植物分子育种：利用高分化SNP标记进行标记辅助选择，加速花期和花序定向改良。
• 花期调控：候选基因如CSTF77、FY可用于研究开花时间调控机制，并开发基因标记。
• 花序结构改良：PNF、FIL、LAS等基因的多基因控制模式为花序花数改良提供靶点。
• 植物基因定位：极端混池法结合F2群体成功定位到染色体7倒位区域，为复杂性状定位提供范例。
• 比较基因组学：两近缘种间染色体倒位与性状关联的比较揭示物种分化遗传基础。