细菌病毒精准区分
一种整合注意力机制的深度神经网络模型,能够基于宿主基因表达同时区分革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和病毒感染三种类型。
Jize, Xie · Zheng, Xubin · Yan, Jianlong · Qizhi, Li · Nana, Jin · Shuojia, Wang · Pengfei, Zhao · 李帅 · Wanfu, Ding · 程立新 · 耿庆山
iScience 2024
模型不仅能区分细菌和病毒感染,还能进一步区分革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌,这是传统方法难以做到的。
模型在六个独立队列上进行了评估,而不是仅在同一数据集内验证,增强了泛化性的可信度。
模型使用了来自 10 个国家 40 个队列的 4,949 个血液样本进行训练,数据多样性高。