实验约束精准对接
将多种实验约束直接整合进深度学习结构预测，无需大规模重训练即可提升蛋白复合物对接精度。
Shihao, Feng · Zhenyu, Chen · Chengwei, Zhang · Yuhao, Xie · Ovchinnikov, Sergey · Gao, Yiqin · Liu, Sirui
Nature Machine Intelligence 2024
该框架通过生成-预测架构，直接将实验约束引入 AlphaFold2 等预训练模型，无需大规模重训练或微调。
在多种实验约束下（包括模拟残基与表面约束、NMR 化学位移扰动、共价标记），ColabDock 的对接精度均优于 HADDOCK 和 ClusPro。
在模拟的界面扫描约束下，ColabDock 可辅助抗体-抗原界面预测，有望用于深度突变扫描等实验数据的解读。