CarbonDesign蛋白设计模型

优于AlphaFold同类

借鉴AlphaFold核心组件、专为蛋白质序列设计而生的模型,能端到端生成精确且鲁棒的序列并附带侧链结构。

Milong, Ren · Yu, Chungong · 卜东波 · 张海仓

Nature Machine Intelligence 2024

技术优势

设计更准

在CASP15、CAMEO等独立测试集上,序列恢复率优于ProteinMPNN等代表性方法。

能零样本预测功能

无需针对特定任务微调即可预测序列变异的功能效应,节省湿实验筛选成本。

附赠侧链结构

多任务学习同时生成序列和侧链结构,为后续评估和优化提供更多信息。

进化信息用得上

通过端到端网络回收技术利用蛋白语言模型中的进化约束,提升设计鲁棒性。

应用场景