Leucaena SNP标记

精准杂交鉴定

一套转录组范围的SNP标记能够可靠地区分银合欢属物种并验证杂种，为育种选择提供快速、准确且成本低廉的工具。

Han, Yong · Alexander, Abair · van der Zanden, Julian · Nageswara-Rao, Madhugiri · Vasan, Saipriyaa · Bhoite, Roopali N. · Castello, Marieclaire · Bailey, C. Donovan · Revell, Clinton K. · Li, Chengdao · Real, Daniel

Agronomy 2024

参数信息

SNP数量
16 million
插入缺失数量
0.8 million
核心变异数量
75,000
等位基因频率均匀的标记数量
1500
杂交验证后代数量
3300

技术优势

杂交后代鉴定可靠

SNP标记在约3300个假定后代中的杂种性测试与田间观察结果高度一致，证明其准确性足以替代田间表型筛选。

全属物种可区分

所鉴定的转录组变异能够区分所有银合欢物种，为物种鉴定和亲本验证提供了通用工具。

可直接开发芯片

约75,000个核心变异可进行遗传定位并转化为基因分型芯片，用于群体遗传学和全基因组关联分析，省去标记开发环节。

应用场景