萝卜染色体级基因组

抽薹延迟可育种

一个647 bp启动子插入等位基因可直接被RsCDF3抑制，导入早抽薹材料可延迟抽薹，是萝卜晚抽薹育种的直接遗传资源。

徐良 · 王燕 · 董俊慧 · Zhang, Wei · Tang, Mingjia · 王凯 · Chen, Yinglong · 张小利 · Zhang, Xinyu · 王林 · Ma, Yinbo · 夏凯 · 柳李旺

Plant Biotechnology Journal 2023

参数信息

基因组大小

476.32 Mb

scaffold N50

56.88 Mb

染色体锚定率

94.08 %

蛋白编码基因数

40306

重复序列比例

52.31 %

SNP数量（对比Xin-li-mei）

2108573

大插入数量（对比Xin-li-mei）

7740

缺失数量（对比Xin-li-mei）

7757

技术优势

晚抽薹有靶点

RsVRN1 启动子上一段647 bp插入可直接被转录抑制子 RsCDF3 结合，降低启动子活性，导致晚抽薹表型。

可转移的等位基因

将这段647 bp插入等位基因导入早抽薹基因型可延迟抽薹时间，直接作为晚抽薹育种的遗传资源。

抗病线索找到

发现多个串联重复基因参与胁迫响应过程，可能解释萝卜高抗病性的独特表型。

应用场景

• 萝卜晚抽薹育种：导入647 bp等位基因，延迟抽薹，无需多代回交。
• 白菜型蔬菜抗病育种：利用串联重复胁迫基因筛选抗病材料。
• 十字花科比较基因组学：用该基因组研究十字花科全基因组三倍化。