菌株构建调度算法

减少36%操作

通过优化基因操作流程,减少构建目标菌株所需的时间和成本。

Cai, Jingyi · 廖小平 · 毛羽丰 · 王若愚 · 李浩然 · 马红武

Biotechnology journal 2023

参数信息

基因操作减少比例
36 %
额外减少比例
10 %

技术优势

操作数减少36%

GSCAS算法识别共用祖先菌株并将菌株聚类,重用这些祖先使需要构建的菌株总数减少,在94个目标菌株的案例中平均减少36%的基因操作。

再少10%

MTM算法在GSCAS基础上进一步最小化所需基因操作,使总操作数再减少10%。

快速找到共同祖先

GSCAS算法能根据菌株遗传组成快速找到共同祖先菌株并将其聚类,为后续优化提供基础。

应用场景