海菜花属叶绿体基因组

75–88个SSR标记

完整叶绿体基因组序列为海菜花属物种鉴定和系统发育重建提供分子数据。

唐健民 · 邹蓉 · Ke, Huang · Limei, Gao · Fengluan, Tang · Ding, Tao · 蒋运生 · 韦霄

Horticulturae 2024

参数信息

叶绿体基因组长度

156,823–162,442 bp

简单序列重复数

75–88

自展支持率

100 %

自展支持率

100 %

技术优势

提供完整叶绿体基因组

为海菜花属物种提供了五份完整的叶绿体基因组序列，长度介于156,823至162,442 bp，可直接用于分析。

含丰富SSR标记

每个基因组含75至88个SSR，可用于物种鉴定。

高支持度系统发育

初步系统发育分析表明O. fengshanensis、O. acuminata和O. guanyangensis以100%自展支持聚为一支。

应用场景

• 水生植物分类：以完整叶绿体基因组澄清海菜花属的分类混乱。
• 物种鉴定：SSR标记可区分海菜花属物种。
• 濒危植物保护：为易危海菜花属植物提供分子鉴定依据。
• 植物系统发育学：提供高支持度的海菜花属系统发育框架。
• 分子标记开发：这些SSR可直接开发为分子标记。