免3D构象预测
该网络在2D拓扑和3D几何模态上融合节点与图级预训练任务,通过对比学习无需显式计算3D构象即可实现准确分子表示。
Ruizhe, Chen · 李春艳 · Wang, Longyue · Mingquan, Liu · Shugao, Chen · Jiahao, Yang · Xiangxiang, Zeng
Information Fusion 2025
通过2D和3D模态间的对比学习,仅用2D分子图即可推断出与使用显式3D几何几乎相同的表示,省去构象生成的高昂计算。
同时结合节点级和图级预训练任务,并共享跨模态的Transformer参数,更全面地捕捉分子结构和语义信息。