Valsa属线粒体基因组
首个Valsa属线粒体基因组
苹果树腐烂病菌和梨树腐烂病菌的完整线粒体基因组，揭示基因重排与系统发育关系，为真菌线粒体演化研究提供新资源。
Xie, Shunpei · Qiao, Zhanxiang · Ma, Qingzhou · 徐超 · 耿月华 · 郭雅双 · 臧睿 · 张猛
Journal of Fungi 2025
参数信息
- 线粒体基因组大小
- 213406 bp
- 线粒体基因组大小
- 128022 bp
- 散在重复序列占比
- 43.56 %
- 散在重复序列占比
- 2.41 %
- 线粒体-核基因组最大比对片段
- 1.73 kb
- 线粒体-核基因组最大比对片段
- 5.17 kb
- 核心蛋白编码基因Ka/Ks比值
- 1
技术优势
数据完整可用
提供两个物种的完整线粒体基因组序列及注释，可直接用于比较分析，省去从头组装的工作。
揭示演化关系
基于线粒体基因集的系统发育分析以高支持度确认两个种为独立分类单元，为分类鉴定提供依据。
发现基因转移
检测到线粒体与核基因组间的大片段序列比对，表明存在基因转移事件，为理解基因组演化提供线索。
应用场景
- 真菌线粒体研究：为真菌线粒体比较基因组学提供首个Valsa属完整参考序列，可用于研究线粒体结构变异与演化。
- 真菌基因组学：补充Valsa属线粒体基因组数据，促进真菌基因组资源整合与系统发育分析。
- 苹果树腐烂病：病原菌线粒体基因组可用于开发分子标记，辅助病害诊断与种群遗传结构研究。